Vinculaciones familiares: Es hijo de William Geovanny Duarte Guerra, un polémico ex alcalde de Santa Catarina Mita, Jutiapa, a quienes las autoridades lo detuvieron en 2017, por el caso de Lavado y Política, señalado de haber sustraído recursos públicos de la comuna de esa localidad.
Duarte Guerra, de acuerdo a las investigaciones, fue ligado a proceso penal por los delitos de testaferrato y falsificación de documentos privados, se desconoce la conclusión del caso.
Posibles tachas: En 2021, Duarte Aguilar, aspirante a la reelección de alcalde del municipio de Santa Catarina Mita, Jutiapa, sufrió un atentado junto a su progenitora.
En 2022, el periódico digital Ojo con mi Pisto, documentó un caso en el que se le señala al candidato de participar en la compra de víveres, láminas y publicidad, para promover su imagen de cara a los comicios de 2023.